Saat geng Kampung Durian Runtuh itu masuk ke dalam portal ajaib tersebut, pintu menuju dunia asli mereka tertutup. Mau tidak mau, Upin Ipin harus melalui kerajaan Inderaloka demi pulang kembali ke kampung mereka.
Rupanya kerajaan Inderaloka itu sedang dalam keadaan yang tidak baik-baik saja. Kerajaan tengah diperintah oleh raja yang lalim bernama Raja Bersiong.
Upin Ipin dan keenam sahabatnya menjalani misi menyelamatkan kerajaan Inderaloka dari raja jahat tersebut. Dalam perjalanannya, Upin Ipin bertemu dengan tokoh bernama Mat Jenin dan Belalang.
Ada babak sedih dalam film Upin Ipin Keris Siamang Tunggal. Sebut saja babak Mak Deruma dan anaknya Si Tanggang yang memiliki kemiripan dengan dongeng Malin Kundang.
Kemudian adegan saat Upin Ipin merindukan Kak Ros dan Opah. Mereka berdua menemukan sebuah lukisan di gua dan langsung teringat dengan kedua orang tersebut yang berada di alam lain.
Bahkan ada kisah Bawang Merah dan Bawang Putih. Cerita rakyat yang ditemukan juga di tanah Jawa. Upin Ipin yang sempat berpisah akhirnya dipertemukan kembali.
Kedua saudara kembar itu sukses bikin penonton menangis. Hingga akhirnya, misi selesai dan Upin Ipin harus meninggalkan kerajaan Inderaloka.
Upin Ipin Keris Siamang Tunggal merupakan film produksi Les' Copaque Production ini membutuhkan waktu 5 tahun proses produksinya dan 4 tahun dalam pembuatan naskah, serta melibatkan 140 kru.