Buya Syakur meninggalkan seorang seorang istri bernama Nyai Zainab Al-Huda dan dua orang anak, Hasyimi Robit Ibdal dan Khozainu Rohmati Robbi Dawud Awwab.
Nyai Zainab Al Huda adalah Istri Buya Yasin yang kedua tak banyak yang informasi mengenai biodata atau profil dari istra buaya sekarang.
Sebelum menikah dengan istri yang sekarang, istri pertama Buya Syakur Yasin adalah Nyai Hj. Masriyah Amva, dia adalah merupakan seorang ulama perempuan yang memimpin Pesantren Kebon Jambu di Cirebon hingga saat ini.
Informasi dari sejumlah sumber Nyai Hj. Masriyah Amva pernah menikah Ustad mereka menetap di Tunisia selama empat tahun.
Namun pernikahan kedua nya hanya bertahan selama delapan tahun lalu keduanya berpisah.
Nyai Hj. Masriyah Amva kemudian menika dengan KH Muhammad pengasuh Pesantren Kebon Melati.
Bersama-sama, mereka mendirikan Pesantren Kebon Jambu, di mana Masriyah istri pertama Buya Syakur Yasin, saat sekarang bertanggung jawab atas pengelolaan pesantren putri pada periode tersebut setelah
KH Muhammad beliau meninggal dunia pada tahun 2007. ***