12. Kecamatan Kawunganten, ada 9 desa rawan banjir:
- Desa Grugu
- Desa Bringkeng
- Desa Ujungmanik
- Desa Bojong
- Desa Mentasan
- Desa Kalijeruk
- Desa Kawunganten
- Desa Kawunganten Lor
- Desa Babakan
13. Kecamatan Bantarsari ada 4 desa rawan banjir:
- Desa Binangun
- Desa Bantarsari
- Desa Rawajaya
- Desa Bulaksari
14. Kecamatan Sampang, 6 desa rawan banjir:
- Desa Karangtengah
- Desa Sampang
- Desa Nusajati
- Desa Karangjati
- Desa Paberasan
- Desa Karangasem
15. Kecamatan Kroya, 6 desa rawan banjir:
- Desa Sikampuh
- Desa Gentasari
- Desa Kedawung
- Desa Mujur
- Desa Buntu
- Desa Mujur Lor
16. Kecamatan Maos, ada 3 desa rawan banjir:
- Desa Karangrena
- Desa Panisihan
- Desa Karangreja
17. Kecamatan Nusawungu, ada 7 desa rawan banjir:
- Desa Banjareja
- Desa Kedungbenda
- Desa Klumprit
- Desa Karangsembung
- Desa Purwodadi
- Desa Nusawangkal
- Desa Nusawungu
18. Kecamatan Adipala, ada 8 desa rawan banjir
- Desa Karangbenda
- Desa Wlahar
- Desa Penggalang
- Desa Adipala
- Desa Adiraja Kulon
- Desa Adiraja Wetan
- Desa Adiraja
- Desa Karangsari
19.Kecamatan Kesugihan, ada 15 rawan banjir :
- Desa Kesugihan
- Desa Karangkandri
- Desa Menganti
- Desa Slarang
- Desa Kalisabuk
- Desa Dondong
- Desa Planjan
- Desa Ciwuni
- Desa Karangjengkol
- Desa Keleng
- Desa Pesanggrahan
- Desa Bulupayung
- Desa Kuripan Kidul
- Desa Jangrana
- Desa Kesugihan Kidul
20. Kecamatan Cilacap Tengah, ada 4 kelurahan rawan banjir:
- Kelurahan Donan
- Kelurahan Kutawaru
- Kelurahan Gunung Simping
- Kelurahan Sidanegara
21. Kecamatan Cilacap Selatan, ada 3 kelurahan rawan banjir:
- Kelurahan Cilacap
- Kelurahan Tambakreja
- Kelurahan Tegalkamulyan.***